MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus plantarum subsp. plantarum P-8 plasmid LBPp5

Total Repeats: 112

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021227	TGG	2	6	28	33	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021227	ATT	2	6	36	41	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021227	GTA	2	6	60	65	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021227	TGA	2	6	181	186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021227	CCA	2	6	281	286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_021227	CGT	2	6	404	409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_021227	ATTA	2	8	443	450	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021227	CCA	2	6	558	563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
9	NC_021227	AT	3	6	586	591	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021227	AAT	2	6	596	601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021227	AT	3	6	655	660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021227	TAA	2	6	661	666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021227	TAAA	2	8	899	906	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021227	A	6	6	914	919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021227	ATC	2	6	927	932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_021227	A	7	7	934	940	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021227	GA	3	6	945	950	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021227	T	6	6	963	968	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021227	CAA	2	6	2967	2972	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_021227	T	7	7	3030	3036	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021227	T	6	6	3239	3244	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021227	AT	3	6	3264	3269	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021227	TAC	2	6	3272	3277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_021227	CTAT	2	8	3284	3291	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021227	CTAT	2	8	3306	3313	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_021227	ACT	2	6	3377	3382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_021227	A	6	6	3406	3411	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021227	ACGCT	2	10	3669	3678	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_021227	AGTT	2	8	3703	3710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021227	TA	4	8	3793	3800	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021227	CAAAAA	2	12	3814	3825	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_021227	TAA	2	6	3872	3877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021227	TCT	2	6	3880	3885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_021227	T	6	6	3890	3895	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021227	AAG	2	6	3904	3909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021227	CTG	3	9	3921	3929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_021227	TGC	2	6	3946	3951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_021227	GCG	2	6	3958	3963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021227	ACC	2	6	3985	3990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_021227	CG	3	6	4003	4008	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_021227	GCG	2	6	4054	4059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_021227	TCC	2	6	4126	4131	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_021227	CGG	2	6	4244	4249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021227	A	6	6	4317	4322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021227	GGA	2	6	4357	4362	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021227	T	6	6	7216	7221	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021227	AAG	2	6	7563	7568	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021227	AAT	2	6	8133	8138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021227	A	6	6	8144	8149	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021227	A	6	6	10198	10203	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021227	CAT	2	6	10240	10245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_021227	CAG	2	6	10257	10262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_021227	A	6	6	10316	10321	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021227	GCA	2	6	10322	10327	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021227	CTG	2	6	10342	10347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_021227	AT	4	8	11015	11022	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021227	TAT	3	9	11020	11028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021227	A	6	6	11654	11659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_021227	AAC	2	6	12422	12427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021227	TCC	2	6	12924	12929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
61	NC_021227	ATTA	2	8	12935	12942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021227	AGG	2	6	12960	12965	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021227	AGT	2	6	13056	13061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_021227	T	6	6	13413	13418	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021227	TTC	2	6	13423	13428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_021227	ATTA	2	8	13476	13483	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021227	A	6	6	13499	13504	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021227	ATT	2	6	13513	13518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021227	ACT	2	6	13534	13539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_021227	GAA	2	6	13546	13551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021227	AATA	2	8	13601	13608	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021227	T	7	7	13642	13648	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021227	T	7	7	13650	13656	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021227	T	6	6	13677	13682	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021227	T	6	6	13735	13740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021227	GTCC	2	8	13780	13787	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_021227	AT	4	8	13834	13841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021227	GA	3	6	13850	13855	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
79	NC_021227	TA	3	6	13911	13916	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021227	TGA	2	6	14019	14024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021227	GATA	2	8	14053	14060	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021227	A	6	6	14132	14137	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021227	CAA	3	9	14233	14241	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_021227	CTA	2	6	14252	14257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_021227	ACT	2	6	14274	14279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_021227	AAC	2	6	14293	14298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_021227	CGA	2	6	14331	14336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_021227	TGGT	2	8	14409	14416	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021227	TAAAT	2	10	14479	14488	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021227	A	7	7	14493	14499	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021227	TCA	2	6	14536	14541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_021227	CTA	2	6	14562	14567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021227	GTAG	2	8	14584	14591	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021227	CAAG	2	8	14654	14661	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_021227	A	6	6	14707	14712	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021227	GCC	2	6	14732	14737	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_021227	GGTT	2	8	14779	14786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021227	CACG	2	8	14801	14808	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_021227	GGGC	2	8	14809	14816	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
100	NC_021227	AAC	2	6	14866	14871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_021227	AAAT	2	8	14875	14882	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021227	T	7	7	14908	14914	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021227	TTAG	2	8	14925	14932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021227	AAC	2	6	14994	14999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021227	TCT	2	6	15009	15014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_021227	AGTT	2	8	15089	15096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021227	T	7	7	15754	15760	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021227	CAG	2	6	15786	15791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_021227	TAA	2	6	15821	15826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021227	GA	3	6	15993	15998	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021227	CTA	2	6	16004	16009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_021227	AAATC	2	10	16069	16078	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.